Kromasil液相色譜柱使用緩衝液或含鹽的流動相，實驗完成後應用10%的甲醇/水衝洗30分鍾，洗掉色譜柱中的鹽，再用甲醇衝洗30分鍾。注意：不能用純水衝洗柱子，應該在水中加入10%的甲醇，防止將填料衝塌陷。
如色譜柱要長時間保存，必須存於合適的溶劑下。對於反相柱可以儲存於純甲醇或乙腈中，正相柱可以儲存於嚴格脫水後的純正己烷中，離子交換柱可以儲存於水(含防腐劑疊化鈉或柳硫汞)中，並將購買新色譜柱時附送的堵頭堵上。儲存的溫度好是室溫。
Kromasil液相色譜柱的使用注意事項：
(1)色譜柱使用前注意事項：
儲存液無特殊說明，均為評價報告所示的流動相。在使用前，一定要注意儲存液與要分析樣品的流動相是否互溶。在反相色譜中，如用高濃度的鹽或緩衝液作洗脫劑，應先用10%左右的低濃度的有機相洗脫劑過渡一下，否則緩衝液中的鹽在高濃度的有機相中很容易析出，堵塞色譜柱。
(2)流動相：
流動相中所使用的各種有機溶劑要盡可能使用色譜純，配流動相的水建議是超純水或全玻璃器皿的雙蒸水。如果將所配得流動相再經過0.45μm的濾膜過濾一次則更好，尤其是含鹽的流動相。另外，裝流動相的容器和色譜係統中的在線過濾器等裝置應該定期清洗或更換。
以常規矽膠為基質的鍵合相填料通常的pH值適用範圍是2.0-8.0。當必須要在pH值適用範圍的邊界條件下使用色譜柱時，每次使用結束後立即用適合於色譜柱儲存並與所使用的流動相互溶的溶劑清洗，並*置換掉原來所使用的流動相。
(3)樣品：
樣品也要盡可能清潔，可選用樣品過濾器或樣品預處理柱(spe)對樣品進行預處理；若樣品不便處理，要使用保護柱。在用正相色譜法分析樣品時，所有的溶劑和樣品應嚴格脫水。
